Докторантура в Винницком политехническом институте (теперь - ВНТУ) была открыта согласно приказу Государственного комитета по народному образованию УССР № 400 от 26 октября 1988 года.

В 1988 г. был произведен первый набор докторантов.

Выпускники докторантуры ВНТУ:
- Осадчук Александр Владимирович, доктор технических наук, профессор, заведующий кафедри радиотехники ВНТУ;
- Бурбело Михаил Иосифович, доктор технических наук, профессор, профессор кафедры электротехнических систем электропотребления и энергетического менеджмента ВНТУ;
- Кучерук Владимир Юрьевич, доктор технических наук, профессор, заведующий кафедри метрологии и промышленной автоматики ВНТУ;
- Шабатура Юрий Васильевич, доктор технических наук, профессор;
- Билинский Иосиф Иосифович, доктор технических наук, профессор, заведующий кафедри электроники ВНТУ;
- Романюк Александр Никифорович, доктор технических наук, профессор, проректор по научно-педагогической роботе по организации учебного процесса и его научного обеспечения ВНТУ;
- Штовба Сергей Дмитриевич, доктор технических наук, профессор, профессор кафедры компьютерных систем управления ВНТУ;
- Мокин Александр Борисович, заведующий кафедры восстановительной энергетики и транспортных электрических систем и комплексов ВНТУ;
- Боцула Мирослав Павлович, доцент кафедры моделирования и мониторинга сложных систем ВНТУ;
- Рубаненко Александр Евгениевич, доцент кафедры электрических станций и систем ВНТУ.

Сейчас докторантская подготовка осуществляется по 3 научным специальностям.

В ВНТУ функционируют два специализированных ученых совета по защите докторских диссертаций.